Protein–RNA interactions for Protein: Q91VA3

Capn8, Calpain-8, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn8Q91VA3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Capn8Q91VA3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms