Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1Q8VDF2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uhrf1Q8VDF2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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