Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fyco1Q8VDC1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms