Protein–RNA interactions for Protein: Q8R317

Ubqln1, Ubiquilin-1, mousemouse

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln1Q8R317 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ubqln1Q8R317 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubqln1Q8R317 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubqln1Q8R317 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubqln1Q8R317 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubqln1Q8R317 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubqln1Q8R317 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubqln1Q8R317 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubqln1Q8R317 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubqln1Q8R317 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubqln1Q8R317 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubqln1Q8R317 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubqln1Q8R317 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubqln1Q8R317 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubqln1Q8R317 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubqln1Q8R317 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubqln1Q8R317 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubqln1Q8R317 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ubqln1Q8R317 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubqln1Q8R317 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ubqln1Q8R317 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubqln1Q8R317 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubqln1Q8R317 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubqln1Q8R317 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubqln1Q8R317 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubqln1Q8R317 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubqln1Q8R317 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubqln1Q8R317 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubqln1Q8R317 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubqln1Q8R317 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubqln1Q8R317 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubqln1Q8R317 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubqln1Q8R317 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ubqln1Q8R317 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubqln1Q8R317 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubqln1Q8R317 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ubqln1Q8R317 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubqln1Q8R317 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubqln1Q8R317 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubqln1Q8R317 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubqln1Q8R317 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ubqln1Q8R317 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubqln1Q8R317 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ubqln1Q8R317 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ubqln1Q8R317 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ubqln1Q8R317 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ubqln1Q8R317 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubqln1Q8R317 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubqln1Q8R317 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubqln1Q8R317 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubqln1Q8R317 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubqln1Q8R317 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubqln1Q8R317 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubqln1Q8R317 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubqln1Q8R317 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubqln1Q8R317 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubqln1Q8R317 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubqln1Q8R317 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubqln1Q8R317 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubqln1Q8R317 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubqln1Q8R317 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubqln1Q8R317 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubqln1Q8R317 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubqln1Q8R317 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubqln1Q8R317 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubqln1Q8R317 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubqln1Q8R317 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubqln1Q8R317 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubqln1Q8R317 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubqln1Q8R317 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubqln1Q8R317 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubqln1Q8R317 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubqln1Q8R317 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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