Protein–RNA interactions for Protein: Q8K558

Treml1, Trem-like transcript 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml1Q8K558 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Treml1Q8K558 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Treml1Q8K558 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Treml1Q8K558 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Treml1Q8K558 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Treml1Q8K558 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Treml1Q8K558 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Treml1Q8K558 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Treml1Q8K558 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Treml1Q8K558 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Treml1Q8K558 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Treml1Q8K558 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Treml1Q8K558 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Treml1Q8K558 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Treml1Q8K558 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Treml1Q8K558 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Treml1Q8K558 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Treml1Q8K558 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Treml1Q8K558 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Treml1Q8K558 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Treml1Q8K558 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Treml1Q8K558 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Treml1Q8K558 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Treml1Q8K558 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Treml1Q8K558 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Treml1Q8K558 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Treml1Q8K558 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Treml1Q8K558 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Treml1Q8K558 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Treml1Q8K558 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Treml1Q8K558 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Treml1Q8K558 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Treml1Q8K558 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Treml1Q8K558 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Treml1Q8K558 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Treml1Q8K558 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Treml1Q8K558 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Treml1Q8K558 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Treml1Q8K558 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Treml1Q8K558 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Treml1Q8K558 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Treml1Q8K558 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Treml1Q8K558 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Treml1Q8K558 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Treml1Q8K558 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Treml1Q8K558 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Treml1Q8K558 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Treml1Q8K558 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Treml1Q8K558 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Treml1Q8K558 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Treml1Q8K558 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Treml1Q8K558 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Treml1Q8K558 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Treml1Q8K558 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Treml1Q8K558 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Treml1Q8K558 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Treml1Q8K558 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Treml1Q8K558 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Treml1Q8K558 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Treml1Q8K558 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Treml1Q8K558 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Treml1Q8K558 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Treml1Q8K558 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Treml1Q8K558 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Treml1Q8K558 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Treml1Q8K558 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Treml1Q8K558 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Treml1Q8K558 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Treml1Q8K558 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Treml1Q8K558 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Treml1Q8K558 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Treml1Q8K558 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Treml1Q8K558 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Treml1Q8K558 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Treml1Q8K558 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms