Protein–RNA interactions for Protein: Q8K411

Pitrm1, Presequence protease, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitrm1Q8K411 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pitrm1Q8K411 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pitrm1Q8K411 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pitrm1Q8K411 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pitrm1Q8K411 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pitrm1Q8K411 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms