Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms