Protein–RNA interactions for Protein: Q8K249

Cd300e, CMRF35-like molecule 2, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300eQ8K249 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cd300eQ8K249 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cd300eQ8K249 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cd300eQ8K249 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cd300eQ8K249 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cd300eQ8K249 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cd300eQ8K249 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cd300eQ8K249 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cd300eQ8K249 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cd300eQ8K249 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cd300eQ8K249 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cd300eQ8K249 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
Cd300eQ8K249 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cd300eQ8K249 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cd300eQ8K249 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cd300eQ8K249 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cd300eQ8K249 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cd300eQ8K249 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cd300eQ8K249 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cd300eQ8K249 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cd300eQ8K249 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Cd300eQ8K249 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cd300eQ8K249 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cd300eQ8K249 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cd300eQ8K249 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cd300eQ8K249 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cd300eQ8K249 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cd300eQ8K249 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cd300eQ8K249 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cd300eQ8K249 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cd300eQ8K249 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cd300eQ8K249 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cd300eQ8K249 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Cd300eQ8K249 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cd300eQ8K249 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cd300eQ8K249 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cd300eQ8K249 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cd300eQ8K249 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cd300eQ8K249 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cd300eQ8K249 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cd300eQ8K249 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cd300eQ8K249 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cd300eQ8K249 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cd300eQ8K249 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cd300eQ8K249 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cd300eQ8K249 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cd300eQ8K249 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cd300eQ8K249 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cd300eQ8K249 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cd300eQ8K249 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cd300eQ8K249 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cd300eQ8K249 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cd300eQ8K249 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cd300eQ8K249 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cd300eQ8K249 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cd300eQ8K249 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cd300eQ8K249 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cd300eQ8K249 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Cd300eQ8K249 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Cd300eQ8K249 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cd300eQ8K249 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cd300eQ8K249 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cd300eQ8K249 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cd300eQ8K249 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Cd300eQ8K249 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cd300eQ8K249 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cd300eQ8K249 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cd300eQ8K249 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cd300eQ8K249 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cd300eQ8K249 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cd300eQ8K249 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cd300eQ8K249 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cd300eQ8K249 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cd300eQ8K249 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cd300eQ8K249 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cd300eQ8K249 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cd300eQ8K249 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cd300eQ8K249 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cd300eQ8K249 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cd300eQ8K249 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cd300eQ8K249 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cd300eQ8K249 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cd300eQ8K249 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cd300eQ8K249 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cd300eQ8K249 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms