Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms