Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHX7

Rftn2, Raftlin-2, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn2Q8CHX7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rftn2Q8CHX7 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rftn2Q8CHX7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rftn2Q8CHX7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms