Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFH6

Sik2, Serine/threonine-protein kinase SIK2, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik2Q8CFH6 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sik2Q8CFH6 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms