Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Usp27Q8CEG8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Usp27Q8CEG8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Usp27Q8CEG8 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp27Q8CEG8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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