Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms