Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms