Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Nhlrc3Q8CCH2 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Nhlrc3Q8CCH2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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