Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S4

Ccdc186, Coiled-coil domain-containing protein 186, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc186Q8C9S4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc186Q8C9S4 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc186Q8C9S4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc186Q8C9S4 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc186Q8C9S4 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc186Q8C9S4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc186Q8C9S4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc186Q8C9S4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc186Q8C9S4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc186Q8C9S4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc186Q8C9S4 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc186Q8C9S4 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc186Q8C9S4 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc186Q8C9S4 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc186Q8C9S4 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc186Q8C9S4 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc186Q8C9S4 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc186Q8C9S4 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc186Q8C9S4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc186Q8C9S4 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc186Q8C9S4 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc186Q8C9S4 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc186Q8C9S4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc186Q8C9S4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc186Q8C9S4 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc186Q8C9S4 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc186Q8C9S4 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc186Q8C9S4 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc186Q8C9S4 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc186Q8C9S4 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc186Q8C9S4 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc186Q8C9S4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc186Q8C9S4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc186Q8C9S4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc186Q8C9S4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc186Q8C9S4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc186Q8C9S4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc186Q8C9S4 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc186Q8C9S4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc186Q8C9S4 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc186Q8C9S4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc186Q8C9S4 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc186Q8C9S4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc186Q8C9S4 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc186Q8C9S4 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc186Q8C9S4 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc186Q8C9S4 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc186Q8C9S4 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc186Q8C9S4 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc186Q8C9S4 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc186Q8C9S4 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc186Q8C9S4 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc186Q8C9S4 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc186Q8C9S4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc186Q8C9S4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc186Q8C9S4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc186Q8C9S4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc186Q8C9S4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc186Q8C9S4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc186Q8C9S4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc186Q8C9S4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc186Q8C9S4 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc186Q8C9S4 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc186Q8C9S4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc186Q8C9S4 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc186Q8C9S4 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc186Q8C9S4 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc186Q8C9S4 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc186Q8C9S4 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc186Q8C9S4 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc186Q8C9S4 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc186Q8C9S4 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc186Q8C9S4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc186Q8C9S4 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc186Q8C9S4 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc186Q8C9S4 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc186Q8C9S4 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc186Q8C9S4 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc186Q8C9S4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc186Q8C9S4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc186Q8C9S4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc186Q8C9S4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc186Q8C9S4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc186Q8C9S4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc186Q8C9S4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc186Q8C9S4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc186Q8C9S4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc186Q8C9S4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc186Q8C9S4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc186Q8C9S4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc186Q8C9S4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc186Q8C9S4 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc186Q8C9S4 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc186Q8C9S4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc186Q8C9S4 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc186Q8C9S4 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc186Q8C9S4 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc186Q8C9S4 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc186Q8C9S4 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc186Q8C9S4 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms