Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6E1

Apol7c, Apolipoprotein L 7c, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7cQ8C6E1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol7cQ8C6E1 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms