Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXQ3

Lrtm1, Leucine-rich repeat and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrtm1Q8BXQ3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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