Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms