Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pdcl3Q8BVF2 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms