Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRE0

Rd3, Protein RD3, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3Q8BRE0 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rd3Q8BRE0 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rd3Q8BRE0 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rd3Q8BRE0 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rd3Q8BRE0 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rd3Q8BRE0 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rd3Q8BRE0 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rd3Q8BRE0 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rd3Q8BRE0 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms