Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms