Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gabra5Q8BHJ7 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms