Protein–RNA interactions for Protein: Q80VL1

Tdrkh, Tudor and KH domain-containing protein, mousemouse

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Length 560 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdrkhQ80VL1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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TdrkhQ80VL1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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TdrkhQ80VL1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TdrkhQ80VL1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms