Protein–RNA interactions for Protein: Q80UU2

Rpp38, Ribonuclease P protein subunit p38, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpp38Q80UU2 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Rpp38Q80UU2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpp38Q80UU2 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Rpp38Q80UU2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpp38Q80UU2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Rpp38Q80UU2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpp38Q80UU2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Rpp38Q80UU2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpp38Q80UU2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpp38Q80UU2 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpp38Q80UU2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Rpp38Q80UU2 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpp38Q80UU2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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