Protein–RNA interactions for Protein: Q80U57

Rims3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims3Q80U57 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rims3Q80U57 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rims3Q80U57 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rims3Q80U57 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rims3Q80U57 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rims3Q80U57 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rims3Q80U57 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rims3Q80U57 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rims3Q80U57 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rims3Q80U57 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rims3Q80U57 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rims3Q80U57 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rims3Q80U57 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rims3Q80U57 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rims3Q80U57 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rims3Q80U57 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rims3Q80U57 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rims3Q80U57 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rims3Q80U57 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rims3Q80U57 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rims3Q80U57 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rims3Q80U57 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rims3Q80U57 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rims3Q80U57 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rims3Q80U57 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rims3Q80U57 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rims3Q80U57 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rims3Q80U57 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rims3Q80U57 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rims3Q80U57 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rims3Q80U57 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rims3Q80U57 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rims3Q80U57 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rims3Q80U57 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rims3Q80U57 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rims3Q80U57 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rims3Q80U57 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rims3Q80U57 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rims3Q80U57 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rims3Q80U57 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rims3Q80U57 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rims3Q80U57 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rims3Q80U57 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rims3Q80U57 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rims3Q80U57 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rims3Q80U57 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rims3Q80U57 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rims3Q80U57 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rims3Q80U57 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rims3Q80U57 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rims3Q80U57 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rims3Q80U57 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rims3Q80U57 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rims3Q80U57 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rims3Q80U57 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rims3Q80U57 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rims3Q80U57 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rims3Q80U57 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rims3Q80U57 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rims3Q80U57 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rims3Q80U57 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rims3Q80U57 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rims3Q80U57 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rims3Q80U57 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rims3Q80U57 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms