Protein–RNA interactions for Protein: Q80U35

Arhgef17, Rho guanine nucleotide exchange factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 2,057 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef17Q80U35 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arhgef17Q80U35 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arhgef17Q80U35 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arhgef17Q80U35 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arhgef17Q80U35 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arhgef17Q80U35 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arhgef17Q80U35 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arhgef17Q80U35 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arhgef17Q80U35 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arhgef17Q80U35 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arhgef17Q80U35 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Arhgef17Q80U35 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arhgef17Q80U35 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arhgef17Q80U35 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Arhgef17Q80U35 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arhgef17Q80U35 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arhgef17Q80U35 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arhgef17Q80U35 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arhgef17Q80U35 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arhgef17Q80U35 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arhgef17Q80U35 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arhgef17Q80U35 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arhgef17Q80U35 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arhgef17Q80U35 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arhgef17Q80U35 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arhgef17Q80U35 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arhgef17Q80U35 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Arhgef17Q80U35 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arhgef17Q80U35 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arhgef17Q80U35 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arhgef17Q80U35 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arhgef17Q80U35 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arhgef17Q80U35 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Arhgef17Q80U35 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Arhgef17Q80U35 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Arhgef17Q80U35 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Arhgef17Q80U35 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arhgef17Q80U35 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arhgef17Q80U35 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arhgef17Q80U35 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arhgef17Q80U35 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Arhgef17Q80U35 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Arhgef17Q80U35 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Arhgef17Q80U35 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Arhgef17Q80U35 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Arhgef17Q80U35 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Arhgef17Q80U35 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Arhgef17Q80U35 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Arhgef17Q80U35 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Arhgef17Q80U35 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Arhgef17Q80U35 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Arhgef17Q80U35 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Arhgef17Q80U35 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Arhgef17Q80U35 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Arhgef17Q80U35 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Arhgef17Q80U35 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Arhgef17Q80U35 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Arhgef17Q80U35 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Arhgef17Q80U35 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Arhgef17Q80U35 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Arhgef17Q80U35 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Arhgef17Q80U35 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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