Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms