Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ClmQ7TSN2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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