Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms