Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

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Length 569 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Shq1Q7TMX5 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Shq1Q7TMX5 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Shq1Q7TMX5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Shq1Q7TMX5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Shq1Q7TMX5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Shq1Q7TMX5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Shq1Q7TMX5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Shq1Q7TMX5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Shq1Q7TMX5 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Shq1Q7TMX5 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Shq1Q7TMX5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Shq1Q7TMX5 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Shq1Q7TMX5 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Shq1Q7TMX5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Shq1Q7TMX5 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Shq1Q7TMX5 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Shq1Q7TMX5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Shq1Q7TMX5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Shq1Q7TMX5 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Shq1Q7TMX5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Shq1Q7TMX5 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Shq1Q7TMX5 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Shq1Q7TMX5 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Shq1Q7TMX5 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Shq1Q7TMX5 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Shq1Q7TMX5 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Shq1Q7TMX5 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Shq1Q7TMX5 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Shq1Q7TMX5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Shq1Q7TMX5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Shq1Q7TMX5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Shq1Q7TMX5 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Shq1Q7TMX5 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Shq1Q7TMX5 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Shq1Q7TMX5 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Shq1Q7TMX5 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Shq1Q7TMX5 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Shq1Q7TMX5 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Shq1Q7TMX5 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Shq1Q7TMX5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Shq1Q7TMX5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Shq1Q7TMX5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Shq1Q7TMX5 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Shq1Q7TMX5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
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Shq1Q7TMX5 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms