Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Rph3alQ768S4 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Rph3alQ768S4 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Rph3alQ768S4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Rph3alQ768S4 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Rph3alQ768S4 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Rph3alQ768S4 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Rph3alQ768S4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rph3alQ768S4 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rph3alQ768S4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rph3alQ768S4 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rph3alQ768S4 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rph3alQ768S4 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rph3alQ768S4 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rph3alQ768S4 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rph3alQ768S4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rph3alQ768S4 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rph3alQ768S4 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rph3alQ768S4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rph3alQ768S4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rph3alQ768S4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rph3alQ768S4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rph3alQ768S4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rph3alQ768S4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rph3alQ768S4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rph3alQ768S4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rph3alQ768S4 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rph3alQ768S4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rph3alQ768S4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rph3alQ768S4 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rph3alQ768S4 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rph3alQ768S4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rph3alQ768S4 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rph3alQ768S4 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rph3alQ768S4 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rph3alQ768S4 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rph3alQ768S4 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rph3alQ768S4 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rph3alQ768S4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rph3alQ768S4 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
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