Protein–RNA interactions for Protein: Q6QD59

Bnip1, Vesicle transport protein SEC20, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip1Q6QD59 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Bnip1Q6QD59 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Bnip1Q6QD59 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Bnip1Q6QD59 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Bnip1Q6QD59 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Bnip1Q6QD59 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Bnip1Q6QD59 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Bnip1Q6QD59 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Bnip1Q6QD59 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Bnip1Q6QD59 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bnip1Q6QD59 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bnip1Q6QD59 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bnip1Q6QD59 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bnip1Q6QD59 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bnip1Q6QD59 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bnip1Q6QD59 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bnip1Q6QD59 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bnip1Q6QD59 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bnip1Q6QD59 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bnip1Q6QD59 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bnip1Q6QD59 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Bnip1Q6QD59 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bnip1Q6QD59 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Bnip1Q6QD59 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bnip1Q6QD59 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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