Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFF0

Scaf4, SR-related CTD-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf4Q6PFF0 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms