Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1C6

Lrig3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig3Q6P1C6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrig3Q6P1C6 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms