Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fndc3bQ6NWW9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fndc3bQ6NWW9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fndc3bQ6NWW9 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fndc3bQ6NWW9 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fndc3bQ6NWW9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fndc3bQ6NWW9 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fndc3bQ6NWW9 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fndc3bQ6NWW9 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Fndc3bQ6NWW9 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fndc3bQ6NWW9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fndc3bQ6NWW9 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fndc3bQ6NWW9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fndc3bQ6NWW9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fndc3bQ6NWW9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fndc3bQ6NWW9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fndc3bQ6NWW9 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fndc3bQ6NWW9 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Fndc3bQ6NWW9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fndc3bQ6NWW9 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms