Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQV7

Edrf1, Erythroid differentiation-related factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edrf1Q6GQV7 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edrf1Q6GQV7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edrf1Q6GQV7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edrf1Q6GQV7 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edrf1Q6GQV7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edrf1Q6GQV7 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edrf1Q6GQV7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edrf1Q6GQV7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edrf1Q6GQV7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edrf1Q6GQV7 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edrf1Q6GQV7 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edrf1Q6GQV7 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edrf1Q6GQV7 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Edrf1Q6GQV7 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edrf1Q6GQV7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edrf1Q6GQV7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edrf1Q6GQV7 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edrf1Q6GQV7 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edrf1Q6GQV7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edrf1Q6GQV7 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edrf1Q6GQV7 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edrf1Q6GQV7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edrf1Q6GQV7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edrf1Q6GQV7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edrf1Q6GQV7 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Edrf1Q6GQV7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Edrf1Q6GQV7 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edrf1Q6GQV7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Edrf1Q6GQV7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Edrf1Q6GQV7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Edrf1Q6GQV7 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Edrf1Q6GQV7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Edrf1Q6GQV7 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Edrf1Q6GQV7 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Edrf1Q6GQV7 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Edrf1Q6GQV7 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Edrf1Q6GQV7 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Edrf1Q6GQV7 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Edrf1Q6GQV7 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Edrf1Q6GQV7 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Edrf1Q6GQV7 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Edrf1Q6GQV7 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Edrf1Q6GQV7 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Edrf1Q6GQV7 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Edrf1Q6GQV7 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Edrf1Q6GQV7 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Edrf1Q6GQV7 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Edrf1Q6GQV7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Edrf1Q6GQV7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Edrf1Q6GQV7 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Edrf1Q6GQV7 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Edrf1Q6GQV7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Edrf1Q6GQV7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Edrf1Q6GQV7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Edrf1Q6GQV7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Edrf1Q6GQV7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Edrf1Q6GQV7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Edrf1Q6GQV7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Edrf1Q6GQV7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Edrf1Q6GQV7 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Edrf1Q6GQV7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Edrf1Q6GQV7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Edrf1Q6GQV7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Edrf1Q6GQV7 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Edrf1Q6GQV7 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Edrf1Q6GQV7 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Edrf1Q6GQV7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Edrf1Q6GQV7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Edrf1Q6GQV7 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Edrf1Q6GQV7 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Edrf1Q6GQV7 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Edrf1Q6GQV7 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Edrf1Q6GQV7 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Edrf1Q6GQV7 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Edrf1Q6GQV7 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Edrf1Q6GQV7 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Edrf1Q6GQV7 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Edrf1Q6GQV7 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Edrf1Q6GQV7 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Edrf1Q6GQV7 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Edrf1Q6GQV7 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Edrf1Q6GQV7 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Edrf1Q6GQV7 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Edrf1Q6GQV7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Edrf1Q6GQV7 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Edrf1Q6GQV7 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Edrf1Q6GQV7 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Edrf1Q6GQV7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Edrf1Q6GQV7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Edrf1Q6GQV7 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Edrf1Q6GQV7 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Edrf1Q6GQV7 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Edrf1Q6GQV7 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Edrf1Q6GQV7 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Edrf1Q6GQV7 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Edrf1Q6GQV7 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Edrf1Q6GQV7 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Edrf1Q6GQV7 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Edrf1Q6GQV7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Edrf1Q6GQV7 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.3 ms