Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms