Protein–RNA interactions for Protein: Q64727

Vcl, Vinculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VclQ64727 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VclQ64727 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VclQ64727 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VclQ64727 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VclQ64727 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VclQ64727 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VclQ64727 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VclQ64727 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VclQ64727 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VclQ64727 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VclQ64727 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VclQ64727 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VclQ64727 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VclQ64727 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VclQ64727 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VclQ64727 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VclQ64727 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VclQ64727 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VclQ64727 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VclQ64727 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VclQ64727 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VclQ64727 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VclQ64727 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VclQ64727 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VclQ64727 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VclQ64727 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VclQ64727 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VclQ64727 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VclQ64727 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VclQ64727 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VclQ64727 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VclQ64727 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VclQ64727 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VclQ64727 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VclQ64727 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VclQ64727 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VclQ64727 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VclQ64727 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VclQ64727 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VclQ64727 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VclQ64727 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VclQ64727 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VclQ64727 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VclQ64727 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VclQ64727 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VclQ64727 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VclQ64727 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VclQ64727 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VclQ64727 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VclQ64727 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VclQ64727 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VclQ64727 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VclQ64727 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VclQ64727 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VclQ64727 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VclQ64727 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VclQ64727 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VclQ64727 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VclQ64727 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VclQ64727 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VclQ64727 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VclQ64727 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VclQ64727 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VclQ64727 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VclQ64727 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VclQ64727 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VclQ64727 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VclQ64727 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VclQ64727 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VclQ64727 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VclQ64727 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VclQ64727 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VclQ64727 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VclQ64727 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VclQ64727 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VclQ64727 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VclQ64727 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VclQ64727 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VclQ64727 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VclQ64727 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VclQ64727 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VclQ64727 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VclQ64727 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VclQ64727 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VclQ64727 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VclQ64727 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VclQ64727 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VclQ64727 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VclQ64727 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VclQ64727 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VclQ64727 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VclQ64727 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VclQ64727 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VclQ64727 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VclQ64727 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VclQ64727 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VclQ64727 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VclQ64727 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VclQ64727 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VclQ64727 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms