Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vat1Q62465 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vat1Q62465 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vat1Q62465 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vat1Q62465 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vat1Q62465 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vat1Q62465 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Vat1Q62465 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vat1Q62465 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vat1Q62465 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vat1Q62465 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vat1Q62465 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Vat1Q62465 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vat1Q62465 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vat1Q62465 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vat1Q62465 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vat1Q62465 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vat1Q62465 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vat1Q62465 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vat1Q62465 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vat1Q62465 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vat1Q62465 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vat1Q62465 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vat1Q62465 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vat1Q62465 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vat1Q62465 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vat1Q62465 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Vat1Q62465 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vat1Q62465 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vat1Q62465 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vat1Q62465 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vat1Q62465 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vat1Q62465 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vat1Q62465 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vat1Q62465 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vat1Q62465 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vat1Q62465 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms