Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcncQ62447 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CcncQ62447 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcncQ62447 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcncQ62447 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CcncQ62447 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CcncQ62447 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CcncQ62447 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CcncQ62447 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CcncQ62447 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CcncQ62447 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms