Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SypQ62277 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SypQ62277 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SypQ62277 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SypQ62277 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SypQ62277 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SypQ62277 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SypQ62277 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SypQ62277 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SypQ62277 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SypQ62277 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SypQ62277 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SypQ62277 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SypQ62277 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SypQ62277 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SypQ62277 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SypQ62277 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SypQ62277 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SypQ62277 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SypQ62277 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SypQ62277 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SypQ62277 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SypQ62277 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SypQ62277 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SypQ62277 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SypQ62277 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SypQ62277 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SypQ62277 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SypQ62277 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SypQ62277 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SypQ62277 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SypQ62277 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SypQ62277 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SypQ62277 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SypQ62277 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SypQ62277 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SypQ62277 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SypQ62277 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SypQ62277 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SypQ62277 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SypQ62277 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SypQ62277 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SypQ62277 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SypQ62277 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SypQ62277 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SypQ62277 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SypQ62277 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SypQ62277 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SypQ62277 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SypQ62277 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SypQ62277 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SypQ62277 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SypQ62277 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SypQ62277 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SypQ62277 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SypQ62277 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SypQ62277 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SypQ62277 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SypQ62277 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SypQ62277 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SypQ62277 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SypQ62277 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SypQ62277 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SypQ62277 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SypQ62277 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SypQ62277 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SypQ62277 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
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SypQ62277 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SypQ62277 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SypQ62277 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SypQ62277 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SypQ62277 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SypQ62277 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SypQ62277 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SypQ62277 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SypQ62277 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SypQ62277 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SypQ62277 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SypQ62277 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SypQ62277 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SypQ62277 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SypQ62277 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SypQ62277 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SypQ62277 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SypQ62277 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SypQ62277 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SypQ62277 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SypQ62277 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SypQ62277 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SypQ62277 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SypQ62277 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SypQ62277 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SypQ62277 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SypQ62277 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SypQ62277 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SypQ62277 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SypQ62277 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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