Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kdm5dQ62240 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kdm5dQ62240 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kdm5dQ62240 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kdm5dQ62240 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kdm5dQ62240 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kdm5dQ62240 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Kdm5dQ62240 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Kdm5dQ62240 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kdm5dQ62240 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kdm5dQ62240 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kdm5dQ62240 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kdm5dQ62240 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kdm5dQ62240 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kdm5dQ62240 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Kdm5dQ62240 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Kdm5dQ62240 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Kdm5dQ62240 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Kdm5dQ62240 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Kdm5dQ62240 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Kdm5dQ62240 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Kdm5dQ62240 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Kdm5dQ62240 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Kdm5dQ62240 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Kdm5dQ62240 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Kdm5dQ62240 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Kdm5dQ62240 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Kdm5dQ62240 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Kdm5dQ62240 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Kdm5dQ62240 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Kdm5dQ62240 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Kdm5dQ62240 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Kdm5dQ62240 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Kdm5dQ62240 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Kdm5dQ62240 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Kdm5dQ62240 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Kdm5dQ62240 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Kdm5dQ62240 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Kdm5dQ62240 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Kdm5dQ62240 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Kdm5dQ62240 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Kdm5dQ62240 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms