Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Rbm38Q62176 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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