Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cln3Q61124 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cln3Q61124 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cln3Q61124 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cln3Q61124 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cln3Q61124 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cln3Q61124 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cln3Q61124 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cln3Q61124 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cln3Q61124 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cln3Q61124 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cln3Q61124 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cln3Q61124 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cln3Q61124 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cln3Q61124 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cln3Q61124 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
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Cln3Q61124 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cln3Q61124 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cln3Q61124 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cln3Q61124 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cln3Q61124 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cln3Q61124 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cln3Q61124 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cln3Q61124 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cln3Q61124 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cln3Q61124 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cln3Q61124 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cln3Q61124 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cln3Q61124 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cln3Q61124 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Cln3Q61124 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cln3Q61124 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Cln3Q61124 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Cln3Q61124 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Cln3Q61124 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Cln3Q61124 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cln3Q61124 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cln3Q61124 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cln3Q61124 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cln3Q61124 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cln3Q61124 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Cln3Q61124 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cln3Q61124 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Cln3Q61124 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cln3Q61124 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cln3Q61124 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Cln3Q61124 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cln3Q61124 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cln3Q61124 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cln3Q61124 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cln3Q61124 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cln3Q61124 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cln3Q61124 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cln3Q61124 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cln3Q61124 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Cln3Q61124 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cln3Q61124 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cln3Q61124 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cln3Q61124 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cln3Q61124 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cln3Q61124 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cln3Q61124 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cln3Q61124 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cln3Q61124 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cln3Q61124 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cln3Q61124 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cln3Q61124 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cln3Q61124 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cln3Q61124 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cln3Q61124 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Cln3Q61124 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms