Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brip1Q5SXJ3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms