Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms