Protein–RNA interactions for Protein: Q5SS91

Sun3, SUN domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sun3Q5SS91 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sun3Q5SS91 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms