Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trdv4Q5R1A3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trdv4Q5R1A3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trdv4Q5R1A3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trdv4Q5R1A3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trdv4Q5R1A3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trdv4Q5R1A3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trdv4Q5R1A3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trdv4Q5R1A3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trdv4Q5R1A3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trdv4Q5R1A3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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