Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

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Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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